研究报告

玉米 ZmZFP36 基因的克隆与生物信息学分析  

肖英粟 , 刘珍 , 陈熹 , 黄志刚 , 蔺万煌*
湖南农业大学, 植物激素与生长发育湖南省重点实验室, 长沙, 410128
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2020年03月16日    接受日期: 2020年03月27日    发表日期: 2021年07月08日
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摘要

(Zea mays)是世界上最重要的粮食作物之一,研究其抗逆性机理有着十分重要的意义。本研究用在线软件预测了玉米 miR408 的靶基因,对其中编码锌指蛋白的靶基因 ZmZFP36 进行了生物信息学分析,并构建了该基因的植物表达载体。研究结果表明,ZmZFP36 的转录本全长为 1 169 bp,无内含子,开放阅读框长度为 702 bp,编码的蛋白质分子量为 24.52 kD;具有亲水性,无跨膜结构域;二级结构包含无规则卷曲、- 螺旋、延伸链和 - 转角,所占比例分别为 69.10%20.60%7.73%2.58%;系统进化树分析表明ZmZFP36 蛋白与小米(Setaria italica)、高粱(Sorghum bicolor)蛋白亲缘关系最近。启动子分析结果表明,它含有低温、干旱及脱落酸等多种非生物胁迫响应元件,有助于后期通过遗传转化的方法进一步研究 miR408 的调控机理。
 

关键词
玉米;microRNA;靶基因; ZmZFP36;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
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